Η Αντιτρομοκρατική έχει ως αποστολή την αντιμετώπιση Ειδικών Εγκλημάτων Βίας, υπάγεται απευθείας στον Αρχηγό της Ελληνικής Αστυνομίας και έχει εδαφική αρμοδιότητα σε όλη την επικράτεια της χώρας (Π.Δ. 14/2001).

Περιλαμβάνει τα ακόλουθα τμήματα:

• Τμήμα Αντιμετώπισης Εσωτερικής Τρομοκρατίας
• Τμήμα Αντιμετώπισης Διεθνούς Τρομοκρατίας 
• Τμήμα Προστασίας Κράτους και Πολιτεύματος
• Τμήμα Επιχειρήσεων και Ειδικών Ελέγχων
• Τμήμα Διοικητικής Υποστήριξης
• Τμήμα Διαχείρισης Τεχνικών και Διαδικτυακών Πληροφοριών 

Ιστορική στιγμή στο έργο της Αντιτρομοκρατικής Υπηρεσίας αποτελεί η εξάρθρωση των τρομοκρατικών οργανώσεων 17 Νοέμβρη, Ε.Λ.Α., Επαναστατικός Αγώνας και οι συλλήψεις μελών της "Συνωμοσίας Πυρήνων της Φωτιάς" 

• Άμεση Δράση
• Ομάδες Δίκυκλης Αστυνόμευσης (ΔΙ.ΑΣ.)
• Διεύθυνση Διαβατηρίων και Εγγράφων Ασφαλείας 
• Διεύθυνση Αντιμετώπισης Ειδικών Εγκλημάτων Βίας (Δ.Α.Ε.Ε.Β.)
• Διεύθυνση Εγκληματολογικών Ερευνών (Δ.Ε.Ε.)
• Διεύθυνση Εσωτερικών Υποθέσεων
• Διεύθυνση Διεθνούς Αστυνομικής Συνεργασίας
• Διεύθυνση Πληροφορικής
• Διεύθυνση Μεταγωγών Δικαστηρίων Αττικής
• Ειδική Κατασταλτική Αντιτρομοκρατική Μονάδα (Ε.Κ.Α.Μ.)
• Τμήμα Εξουδετέρωσης Εκρηκτικών Μηχανισμών (Τ.Ε.Ε.Μ.)
• Εναέρια Μέσα Σωμάτων Ασφαλείας
• Διεύθυνση Διαχείρισης και Ανάλυσης Πληροφοριών
• Διεύθυνση Οικονομικής Αστυνομίας
• Διεύθυνση Δίωξης Ηλεκτρονικού Εγκλήματος
• Γενική Διεύθυνση Προστασίας Επισήμων και Ευπαθών Στόχων
• Ομάδα Αστυνομικών Σκύλων
• Διεύθυνση Υγειονομικού
• Ενιαίο Συντονιστικό Κέντρο Επιχειρήσεων και Διαχείρισης Κρίσεων
• Θρησκευτική Υπηρεσία