Η Δ.Α.Ο.Α. υπάγεται απευθείας στον Αρχηγό της Ελληνικής Αστυνομίας και διοικείται από τον Υποστράτηγο της Ελληνικής Αστυνομίας Βασίλειο Κωνσταντινίδη.

Είναι οργανωμένη σε τέσσερις διοικητικές μονάδες - Υποδιευθύνσεις:

• Σχεδιασμού Επιχειρήσεων
• Διοικητικής Υποστήριξης
• Κέντρου Διοίκησης & Ελέγχου

Εχει επανδρωθεί με προσωπικό:

• της Ελληνικής Αστυνομίας
• του Λιμενικού Σώματος
• του Πυροσβεστικού Σώματος
• της Εθνικής Υπηρεσίας Πληροφοριών
• των Ενόπλων Δυνάμεων

Παράλληλα, συνεργάζεται με 72 ακόμα φορείς μεταξύ των οποίων είναι:

• η Γενική Γραμματεία Πολιτικής Προστασίας
• το Εθνικό Κέντρο Aμεσης Βοήθειας (ΕΚΑΒ)
• η Υπηρεσία Πολιτικής Αεροπορίας
• η Εθνική Μετεωρολογική Υπηρεσία

Ειδικότερα, υπάρχει συνεργασία με εκπροσώπους επτά (7) χωρών (Αυστραλία, Γαλλία, Γερμανία, Ηνωμένο Βασίλειο, Η.Π.Α., Ισπανία και Ισραήλ), που διαθέτουν σημαντική εμπειρία και τεχνογνωσία σε θέματα διοργάνωσης μεγάλων αθλητικών εκδηλώσεων και ιδιαίτερα Ολυμπιακών Αγώνων, καθώς επίσης και σε θέματα ασφάλειας. Απαρτίζουν την Ολυμπιακή Συμβουλευτική Ομάδα (Ο.Σ.Ο.) σε ρόλο υποστηρικτικό-συμβουλευτικό, από την αρχή του Σχεδιασμού, μέχρι και τη λήξη των Αγώνων.

Αναπτύσσεται επίσης, ειδική συνεργασία για την Ολυμπιακή Ασφάλεια, με τα Κράτη - Μέλη της Ευρωπαϊκής Ένωσης, δεδομένου ότι η Ελλάδα είναι το πρώτο Κράτος-Μέλος, που διοργανώνει Ολυμπιακούς Αγώνες, μετά την εφαρμογή του κεκτημένου Schengen.

Αναπτύσσονται, τέλος, συνεργασίες με διεθνείς Oργανισμούς διαφόρων χωρών ανά την υφήλιο και Yπηρεσίες όπως είναι η Interpol και η Europol. Συνεργασίες, που διευρύνουν τις δυνατότητές της Ελληνικής Αστυνομίας και λειτουργούν προσθετικά στο επίπεδο της ασφάλειας.

Παράλληλα, υπάρχει και η συνδρομή του ΝΑΤΟ, η οποία περιλαμβάνει:

• 24ωρη επιτήρηση του εναέριου χώρου μέσω συστημάτων ραντάρ και χρήσης των AWACS 
•  Παρουσία και διενέργεια νηοψιών στην περιοχή της ανατολικής Μεσογείου
• Ανταλλαγή και διαχείριση πληροφοριών
• Παροχή εξοπλισμού για την αντιμετώπιση χημικής, βιολογικής, ραδιολογικής και πυρηνικής απειλής (X.B.Ρ.Π.).